Miembros:

I. Xemnas
Xemnas, "El Superior" o el Gran Mentor segun algunos (ゼムナス, Zemunasu?), es el incorpóreo de Xehanort, líder de la Organización, y antagonista principal de Kingdom Hearts II. Su nombre es sacado de un anagrama de "Ansem" sumándole una "X", debido a que Xehanort toma el nombre de su mentor antes del desechar su cuerpo. Su incorpóreo asignado es el Hechicero. Xemnas es doblado por Paul St. Peter en la versión inglesa de Kingdom Hearts II, y por Norio Wakamoto en la versión japonesa. En la batalla, Xemnas usa láminas de energía llamadas Láminas Aéreas, que se extienden de sus palmas o son usadas como proyectiles; y el poder de nada. Xemnas aparece por primera vez en Kingdom Hearts: Final Mix como un jefe adicional para aquella versión. En esta versión, el jugador tiene la opción de iniciar una batalla con "Unknown" (謎の男, Nazo no Otoko?, lit. "Hombre Desconocido") en Bastión Hueco. Las escenas de antes y después de la batalla sirven como presagio para más tarde trazar acontecimientos relacionados con Roxas y la identidad de los "Unknown". En Kingdom Hearts: Chain of Memories, Xemnas es mencionado como "el Superior" por otros miembros de la Organización. Vexen acepta rápidamente eliminar a Sora cuando Marluxia hace la amenaza de contar a Xemnas el fracaso de su Réplica de Riku. En Kingdom Hearts II, Xemnas aparece al principio, en los sueños de Roxas, cuando éste lucha para recordar lo que es. Xemnas hace dos apariciones posteriores en Bastión Hueco; y en la segunda, su rostro es descubierto, y su identidad, revelada. Su complot es explicado, y se revela cómo usará el aumento del poder de Kingdom Hearts, que es la fuente de corazones, y adonde van los corazones liberados por Sora (cada sincorazón derrotado significa un corazón más para Kingdom Hearts). Xemnas aparece otra vez en el Mundo Inexistente, hablando con Saïx; y otra vez cuando DiZ intenta contener el poder de Kingdom Hearts. Los dos hablan, y Xemnas revela que sólo trataba de construir un nuevo imperio "corazón a corazón", y agradece a su antiguo maestro por esto, declarando que Ansem el Sabio es "la fuente de todos los sincorazón". DiZ, sin embargo, afirma que Xemnas no ha aprendido nada, y es por eso que su complot fallará en última instancia. La máquina de DiZ explota, dejando un enorme agujero en el Kingdom Hearts, que provoca que lluevan muchos de los corazones que, a su vez, se convierten en sincorazón. Xemnas usa el poder que le queda a Kingdom Hearts, invocando las emociones de la rabia y el odio, y toma una nueva forma para luchar contra Sora y sus amigos. Cuando piensan que estaba a punto de ser derrotado, Xemnas logra separar Sora y Riku de los demás para luchar con ellos, pero sus esfuerzos fallan ,y los dos derrotan a Xemnas, quien entonces se desaparece en la oscuridad. Muchas de las escenas añadidas en Kingdom Hearts II: Final Mix muestran a Xemnas participando en reuniones de la Organización XIII, y en una es visto entrando en un cuarto personal llamado "Sala del Sueño", en las profundidades de su antiguo laboratorio, y hablándole a la armadura vacía de Aqua, una portadora de Llave espada (quien también aparece en los vídeos Sunset Horizons y Birth by Sleep), llamándola "amigo". En una discusión entre Zexión y Xigbar, éste indica una conexión entre el "Castillo del Olvido", especialmente en "La Sala del Despertar", y la localización de otro "amigo" al que Xemnas busca.